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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
19/04/1995 |
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Data da última atualização: |
19/04/1995 |
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Autoria: |
WANG, H. C.; BAU, J. H. and YEH, D. S. |
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Afiliação: |
Departament of plant Pathology, National Chung Hsing University, Taichung, Taiwan, R.O.C. |
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Título: |
Comparison of the Nuclear Inclusion b Protein and Coat Protein Genes of Five Papaya Ringspot Virus Strains Distinct in Geographic Origin andPathogenicity. |
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Ano de publicação: |
1994 |
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Fonte/Imprenta: |
The American Phytopathological Society vol.84 (10), 1994. |
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ISSN: |
0331-949X |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A complementary DNA library was constructed to the genomic RNA of an isolate of papaya ringspot virus (PRSV), PRSV YK (YK), that represents the most prevalent mosaic strain of Taiwan. A 2.96-kb clone, pYKB9, corresponding to the 3'-region of YK RNA was selected by immunoscreening with the antiserum to the coat protein (CP). The clone had 2,960 nucleotide residuesand represented part of the nuclear inclusion a (NLa) gene, the complete nuclear inclusion b (NLb) gene, the entire CP gene, and the 3'-noncoding region of YK RNA. The nucleotide sequence was compared to those of the 3' regions of the published Hawaii severe strain, PRSV HA (HA), the Hawaii mild strain PRSV HA 5-1 (HA 5-1), the monpapaya-infecting Florida strain, PRSV W(fl) (W(fl), and the monpapaya-infecting Australia strain PRSV W(aust) (W(aust)). The NIb region had 83.1% nucleotide identity and 95.7% amino acid identity compared to thatof HA, with a total of 262 nucleotide differences resulting in only 22 amino acid changes. A similar trend also was found when the NIb region of YK was compared to the partially elucidated NIb regions of HA 5-1and PRSV W(fl), with 84.7 and 85.2% nucleotide identities (147 and 151 nucleotide differences), respectively: both resulting in 97.6% amino acid identity (only eight amino acid changes). Most of the nucleotide differences between the Asian and American strains occurred in wobble bases and, thus, conserved the amino acid residues, suggesting a common selection pressure to keep the same protein conformation. MenosA complementary DNA library was constructed to the genomic RNA of an isolate of papaya ringspot virus (PRSV), PRSV YK (YK), that represents the most prevalent mosaic strain of Taiwan. A 2.96-kb clone, pYKB9, corresponding to the 3'-region of YK RNA was selected by immunoscreening with the antiserum to the coat protein (CP). The clone had 2,960 nucleotide residuesand represented part of the nuclear inclusion a (NLa) gene, the complete nuclear inclusion b (NLb) gene, the entire CP gene, and the 3'-noncoding region of YK RNA. The nucleotide sequence was compared to those of the 3' regions of the published Hawaii severe strain, PRSV HA (HA), the Hawaii mild strain PRSV HA 5-1 (HA 5-1), the monpapaya-infecting Florida strain, PRSV W(fl) (W(fl), and the monpapaya-infecting Australia strain PRSV W(aust) (W(aust)). The NIb region had 83.1% nucleotide identity and 95.7% amino acid identity compared to thatof HA, with a total of 262 nucleotide differences resulting in only 22 amino acid changes. A similar trend also was found when the NIb region of YK was compared to the partially elucidated NIb regions of HA 5-1and PRSV W(fl), with 84.7 and 85.2% nucleotide identities (147 and 151 nucleotide differences), respectively: both resulting in 97.6% amino acid identity (only eight amino acid changes). Most of the nucleotide differences between the Asian and American strains occurred in wobble bases and, thus, conserved the amino acid residues, suggesting a common selection pressure to keep ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Amino acid sequence. |
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Thesaurus Nal: |
Potyvirus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aA complementary DNA library was constructed to the genomic RNA of an isolate of papaya ringspot virus (PRSV), PRSV YK (YK), that represents the most prevalent mosaic strain of Taiwan. A 2.96-kb clone, pYKB9, corresponding to the 3'-region of YK RNA was selected by immunoscreening with the antiserum to the coat protein (CP). The clone had 2,960 nucleotide residuesand represented part of the nuclear inclusion a (NLa) gene, the complete nuclear inclusion b (NLb) gene, the entire CP gene, and the 3'-noncoding region of YK RNA. The nucleotide sequence was compared to those of the 3' regions of the published Hawaii severe strain, PRSV HA (HA), the Hawaii mild strain PRSV HA 5-1 (HA 5-1), the monpapaya-infecting Florida strain, PRSV W(fl) (W(fl), and the monpapaya-infecting Australia strain PRSV W(aust) (W(aust)). The NIb region had 83.1% nucleotide identity and 95.7% amino acid identity compared to thatof HA, with a total of 262 nucleotide differences resulting in only 22 amino acid changes. A similar trend also was found when the NIb region of YK was compared to the partially elucidated NIb regions of HA 5-1and PRSV W(fl), with 84.7 and 85.2% nucleotide identities (147 and 151 nucleotide differences), respectively: both resulting in 97.6% amino acid identity (only eight amino acid changes). Most of the nucleotide differences between the Asian and American strains occurred in wobble bases and, thus, conserved the amino acid residues, suggesting a common selection pressure to keep the same protein conformation.
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700 1 $aBAU, J. H. and YEH, D. S.
773 $tThe American Phytopathological Society vol.84 (10), 1994.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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| 8. |  | RODRIGUES, T. B.; KHAJURIA, C.; WANG, H.; MATZ, N.; CARDOSO, D. C.; VALICENTE, F. H.; ZHOU, X.; SIEGFRIED, B. Validation of reference housekeeping genes for gene expression studies in western corn rootworm (Diabrotica virgifera virgifera). Plos One, San Francisco,v. 9, n. 10, p. 1-8, Oct. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 9. | | ANHOLETO, L. A.; BLANCHARD, S.; WANG, H. V.; CHAGAS, A. C. de S.; HILLER, N. K.; FARAONE, N. In vitro acaricidal activity of essential oils and their binary mixtures against ixodes scapularis (Acari: Ixodidae). Ticks and Tick-borne Diseases, v. 15, n. 2, mar. 2024, 102309.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 10. | | PINHEIRO, D. H.; VÉLEZ, A. M.; FISHILEVICH, E.; WANG, H.; CARNEIRO, N. P.; VALENCIA-JIMÉNEZ, A.; VALICENTE, F. H.; NARVA, E. K.; SIEGFRIED, B. D. Clathrin-dependent endocytosis is associated with RNAi response in the western corn rootworm, Diabrotica virgifera virgifera LeCont. Plos One, v. 13, n. 8, e0201849, Aug. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 11. | | KHAJURIA, C.; VÉLEZ, A. M.; RANGASAMY, M.; WANG, H.; FISHILEVICH, E.; FREY, M. L. F.; CARNEIRO, N. P.; GANDRA, P.; NARVA, K. E.; SIEGFRIE, B. D. Parental RNA interference of genes involved in embryonic development of the western corn rootworm, Diabrotica virgifera virgifera LeConte. Insect Biochemistry and Molecular Biology, Oxford, v. 63, p. 54-62, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 12. | | ELLIOTT, G. N.; CHEN, W. M.; CHOU, J. H.; WANG, H. C.; SHEU, S. Y.; PERIN, L.; REIS, V. M.; MOULIN, L.; SIMON, M. F.; BONTEMPS, C.; SUTHERLAND, J. M.; BESSI, R.; FARIA, S. M. de; TRINICK, M. J.; PRESCOTT, A. R.; SPRENT, J. I.; JAMES, E. K. Burkholderia phymatum is a highly effective nitrogen-fixing symbiont of Mimisa app. and fixes nitrogen ex planta new phytologist, v.173, p. 168-180, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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| 13. | | ELLIOTT, G. N.; CHEN, W. -M.; CHOU, J. -H.; WANG, H. -C.; SHEU, S. -Y.; PERIN, L.; REIS, V. M.; MOULIN, L.; SIMON, M. F.; BONTEMPS, C.; SUTHERLAND, J. M.; BESSI, R.; FARIA, S. M. de; TRINICK, M. J.; PRESCOTT, A. R.; SPRENT, J. I.; JAMES, E. K. Burkholderia phymatum is a highly effective nitrogen-fixing symbiont of Mimosa spp. and fixes nitrogen ex planta. New Phytologist, Oxford, v. 173, n. 1, p. 168-180, jan. 2007. Parceria: Universidade de Dundee, Universidade National Kaohsiung Marine/Taiwan, Laboratorio de Simbiose Tropical/IRD/CIRAD/INRA/AGROM/UMII, Embrapa Sede, Universidade York| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - B |
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| 14. | | NORIEGA, D. D.; ARIAS, P. L.; BARBOSA, H. R.; ARRAES, F. B. M.; OSSA, G. A.; VILLEGAS, B.; COELHO, R. R.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; WANG, H.; VÉLEZ, A. M.; ARBOLEDA, J. W.; GROSSI-DE-SA, M. F.; SILVA, M. C. M.; VALENCIA-JIMÉNEZ, A. Transcriptome and gene expression analysis of three developmental stages of the coffee berry borer, Hypothenemus hampei. Scientific Reports, v.9, n. 1, article 12804, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 16. | | PASTORELLO, G.; TROTTA, C.; CANFORA, E.; CHU, H.; CHRISTIANSON, D.; CHEAH, Y.; POINDEXTER, C.; CHEN, J.; ELBASHANDY, A.; HUMPHREY, M.; ISAAC, P.; POLIDORI, D.; RIBECA, A.; VAN INGEN, C.; ZHANG, L.; AMIRO, B.; AMMANN, C.; ARAIN, M. A.; ARDÖ, J.; ARKEBAUER, T.; ARNDT, S. K.; ARRIGA, N.; AUBINET, M.; AURELA, M.; BALDOCCHI, D.; BARR, A.; BEAMESDERFER, E.; BELELLI, L. M.; BERGERON, O.; BERINGER, J.; BERNHOFER, C.; BERVEILLER, D.; BILLESBACH, D.; BLACK, T. A.; BLANKEN, P. D.; BOHRER, G.; BOIKE, J.; BOLSTAD, P. V.; BONAL, D.; BONNEFOND, J.; BOWLING, D. R.; ROSVEL, B.; BRODEUR, J.; BRÜMMER, C.; BUCHMANN, N.; BURBAN, B.; BURNS, S. P.; BUYSSE, P.; CALE, P.; CAVAGNA, M.; CELLIER, P.; CHEN, S.; CHINI, I.; CHRISTENSEN, T. R.; CLEVERLY, J.; COLLALTI, A.; CONSALVO, C.; COOK, B. D.; COOK, D.; COURSOLLE, C.; CREMONESE, E.; CURTIS, P. S.; D'ANDREA, E.; ROCHA, H. da; DAI, X.; DAVIS, K. J.; DE CINTI, B.; DE GRANDCOURT, A.; DE LIGNE, A.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; DELPIERRE, N.; DESAI, A. R.; DI BELLA, C. M.; DI TOMMASI, P.; DOLMAN, H.; DOMINGO, F.; DONG, G.; DORE, S.; DUCE, P.; DUFRÊNE, E.; DUNN, A.; DUSEK, J.; EAMUS, D.; EICHELMANN, U.; ELKHIDIR, H. A. M.; EUGSTER, W.; EWENZ, C. M.; EWERS, B.; FAMULARI, D.; FARES, S.; FEIGENWINTER, I.; FEITZ, A.; FENSHOLT, R.; FILIPPA, G.; FISCHER, M.; FRANK, J.; GALVAGNO, M.; GHARUN, M.; GIANELLE, D.; GIELEN, B.; GIOLI, B.; GITELSON, A.; GODED, I. B.; GOECKEDE, M.; GOLDSTEIN, A. H.; GOUGH, C. M.; GOULDEN, M. L.; GRAF, A.; GRIEBEL, A.; GRUENING, C.; GRÜNWALD, T.; HAMMERLE, A.; HAN, S.; HAN, X.; HANSEN, B. U.; HANSON, C.; HATAKKA, J.; HE, Y.; HEHN, M.; HEINESCH, B.; HINKO-NAJERA, N.; HÖRTNAGL, L.; HUTLEY, L.; IBROM, A.; IKAWA, H.; JACKOWICZ-KORCZYNSKI, M.; JANOUS, D.; JANS, W.; JASSAL, R.; JIANG, S.; KATO, T.; KHOMIK, M.; KLATT, J.; KNOHL, A.; KNOX, S.; KOBAYASHI, H.; KOERBER, G.; KOLLE, O.; KOSUGI, Y.; KOTANI, A.; KOWALSKI, A.; KRUIJT, B.; KURBATOVA, J.; KUTSCH, W. L.; KWON, H.; LAUNIAINEN, S.; LAURILA, T.; LAW, B.; LEUNING, R.; LI, Y.; LIDDELL, M.; LIMOUSIN, J.; LION, M.; LISKA, A.; LOHILA, A.; LÓPEZ-BALLESTEROS, A.; LÓPEZ-BLANCO, E.; LOUBET, B.; LOUSTAU, D.; LUCAS-MOFFAT, A.; LÜERS, J.; MA, S.; MACFARLANE, C.; MAGLIULO, V.; MAIER, R.; MAMMARELLA, I.; MANCA, G.; MARCOLLA, B.; MARGOLIS, H.; MARRAS, S.; MASSMAN, W.; MASTEPANOV, M.; MATAMALA, R.; MATTHES, J. H.; MAZZENGA, F.; MCCAUGHEY, H.; MCHUGH, I.; MCMILLAN, A. M. S.; MERBOLD, L.; MEYER, W.; MEYERS, T.; MILLER, S. D.; MINERBI, S.; MODEROW, U.; MONSON, R. K.; MONTAGNANI, L.; MOORE, C. E.; MOORS, E.; MOREAUX, V.; MOUREAUX, C.; MUNGER, J. W.; NAKAI, T.; NEIRYNCK, J.; NESIC, Z.; NICOLINI, G.; NOORMETS, A.; NORTHWOOD, M.; NOSETTO, M.; NOUVELLON, Y.; NOVICK, K.; WALTER, O.; OLESEN, J. E.; OURCIVAL, J.; PAPUGA, S. A.; PARMENTIER, F.; PAUL-LIMOGES, E.; PAVELKA, M.; PEICHL, M.; PENDALL, E.; PHILLIPS, R. P.; PILEGAARD, K.; PIRK, N.; POSSE, G.; POWELL, T.; PRASSE, H.; PROBER, S. M.; RAMBAL, S.; RANNIK, U.; RAZ-YASEEF, N.; REED, D.; RESCO DE DIOS, V.; RESTREPO-COUPE, N.; REVERTER, B. R.; ROLAND, M.; SABBATINI, S.; SACHS, T.; SALESKA, S. R.; SÁNCHEZ-CAÑETE, E. P.; SANCHEZ-MEJIA, Z. M.; SCHMID, H. P.; SCHMIDT, M.; SCHNEIDER, K.; SCHRADER, F.; SCHRODER, I.; SCOTT, R. L.; SEDLÁK, P.; SERRANO-ORTÍZ, P.; SHAO, C.; SHI, P.; SHIRONYA, I.; SIEBICKE, L.; SIGUT, L.; SILBERSTEIN, R.; SIRCA, C.; SPANO, D.; STEINBRECHER, R.; STEVENS, R. M.; STURTEVANT, C.; SUYKER, A.; TAGESSON, T.; TAKANASHI, S.; TANG, Y.; TAPPER, N.; THOM, J.; TIEDEMANN, F.; TOMASSUCCI, M.; TUOVINEN, J.; URBANSKI, S.; VALENTINI, R.; VAN DER MOLEN, M.; VAN GORSEL, E.; VAN HUISSTEDEN, K.; VARLAGIN, A.; VERFAILLIE, J.; VESALA, T.; VINCKE, C.; VITALE, D.; VYGODSKAYA, N.; WALKER, J. P.; WALTER-SHEA, E.; WANG, H.; WEBER, R.; WESTERMANN, S.; WILLE, C.; WOFSY, S.; WOHLFAHRT, G.; WOLF, S.; WOODGATE, W.; YUELIN, L.; ZAMPEDRI, R.; ZHANG, J.; ZHOU, G.; ZONA, D.; AGARWAL, D.; BIRAUD, S.; TORN, M.; PAPALE, D. The FLUXNET2015 dataset and the ONEFlux processing pipeline for eddy covariance data. Scientific Data, v. 7, Article number 225, 2020. 27 p.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 17. | | KATTGE, J.; BÖNISCH, G.; DÍAZ, S.; LAVOREL, S.; PRENTICE, I. C.; LEADLEY, P.; TAUTENHAHN, S.; WERNER, G. D. A; AAKALA, T.; ABEDI, M; ACOSTA, A. T. R.; ADAMIDIS, G. C.; ADAMSON, K.; AIBA, M.; ALBERT, C. H; ALCÁNTARA, J. M.; ALCÁZAR, C.; ALEIXO, I.; ALI, H; AMIAUD, B.; AMMER, C.; AMOROSO, M. M.; ANAND, M; ANDERSON, C.; ANTEN, N.; ANTOS, J.; APGAUA, D. M. G.; ASHMAN, T. L.; ASMARA, D. H.; ASNER, G. P.; ASPINWALL, M.; ATKIN, O.; AUBIN, I.; BAASTRUP-SPOHR, L.; BAHALKEH, K.; BAHN, M; BAKER, T.; BAKER, W. J.; BAKKER, J. P.; BALDOCCHI, D.; BALTZER, J.; BANERJEE, A.; BARANGER, A.; BARLOW, J.; BARNECHE, D. R.; BARUCH, Z.; BASTIANELLI, D.; BATTLES, J.; BAUERLE, W.; BAUTERS, M.; BAZZATO, E.; BECKMANN, M.; BEECKMAN, H.; BEIERKUHNLEIN, C.; BEKKER, R; BELFRY, G.; BELLUAU, m.; BELOIU, M.; BENAVIDES, R.; BENOMAR, L.; BERDUGO-LATTKE, M. L.; BERENGUER, E.; BERGAMIN, R.; BERGMANN, J.; CARLUCCI, M. G.; BERNER, L.; BERNHARDT-RÖMERMANN, M.; BIGLER, C.; BJORKMAN, A. D.; BLACKMAN, C.; BLANCO, C.; BLONDER, B.; BLUMENTHAL, D.; BOCANEGRA-GONZÁLEZ, K. T.; BOECKX, P.; BOHLMAN, S.; BÖHNING-GAESE, K.; BOISVERT-MARSH, L.; BOND, W.; BOND-LAMBERTY, B.; BOOM, A.; BOONMAN, C. C. F.; KAUANE BORDIN; BOUGHTON, E. H.; BOUKILI, V.; BOWMAN, D. J. S.; BRAVO, S.; BRENDEL, M. R.; BROADLEY, M. R; BROWN, K. A.; BRUELHEIDE, H.; BRUMNICH, F.; BRUUN, H. H.; BRUY, D.; BUCHANAN, S. W.; BUCHER, S. F.; BUCHMANN, N.; BUITENWERF, R.; BUNKER, D. E.; BÜRGER, J.; BURRASCANO, S.; BURSLEM, D. F. R. P; BUTTERFIELD, B. J.; BYUN, C.; SCALON, M. C; CACCIANIGA, M.; CADOTTE, M.; CAILLERET, M.; CAMAC, J.; CAMARERO, J. J.; CAMPANY, C; CAMPETELLA, G.; CAMPOS, J. A.; CANO-ARBOLEDA, L.; CANULLO, R.; CARBOGNANI, M.; CARVALHO, F.; CASANOVES, F.; CASTAGNEYROL, B.; CATFORD, J. A.; CAVENDER-BARES, J.; CERABOLINI, B. E. L.; CERVELLINI, M; CHACÓN-MADRIGAL, E.; CHAPIN, K.; CHAPIN, F. S.; CHELLI, S; CHEN, S. C.; CHEN, A.; CHERUBINI, P.; CHIANUCCI, F.; CHOAT, B.; CHUNG, K. S.; CHYTRÝ, M.; CICCARELLI, D.; COLL, L.; COLLINS, C. G.; CONTI, L.; COOMES, D.; CORNELISSEN, J. H. C.; CORNWELL, W. K.; CORONA, P.; COYEA, M.; CRAINE, J.; CRAVEN, D.; CROMSIGT, J. P. G. M.; CSECSERITS, A; CUFAR, K.; CUNTZ, M.; SILVA, A. C. da; DAHLIN, K. M.; DAINESE, M.; DALKE, I.; FRATTE, M. D.; DANG-LE, A. T.; DANIHELKA, J.; DANNOURA, M.; DAWSON, S.; BEER, A. J. de; FRUTOS, A. de; LONG, J. R. de; DECHANT, B.; DELAGRANGE, S.; DELPIERRE, N.; DERROIRE, G.; DIAS, A. S.; DIAZ-TORIBIO, M. H.; DIMITRAKOPOULOS, P. G.; DOBROWOLSKI, M.; DOKTOR, D.; DREVOJAN, P.; DONG, N.; DRANSFIELD, J.; DRESSLER, S.; DUARTE, L.; DUCOURET, E.; DULLINGER, S.; DURKA, W.; DUURSMA, R.; DYMOVA, O.; E-VOJTKÓ, A.; ECKSTEIN, R. L.; EJTEHADI, H.; ELSER, J.; EMILIO, T.; ENGEMANN, K.; ERFANIAN, M. B.; ERFMEIER, A.; ESQUIVEL-MUELBERT, A.; ESSER, G.; ESTIARTE, M.; DOMINGUES, T. F.; FAGAN, W. F.; FAGÚNDEZ, J.; FALSTER, D. 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| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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